MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011988	CTG	2	6	513518	513523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011988	GCAA	2	8	513539	513546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_011988	ACG	2	6	513601	513606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011988	AAAT	2	8	520059	520066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011988	A	7	7	520119	520125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011988	ACC	2	6	520206	520211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_011988	CTT	2	6	522359	522364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011988	CAG	2	6	527780	527785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011988	CTG	2	6	527907	527912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011988	T	6	6	527941	527946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011988	CCA	2	6	532581	532586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_011988	TCCC	2	8	533749	533756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1013	NC_011988	CGGA	2	8	533837	533844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_011988	TTCCGC	2	12	536187	536198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_011988	CGGG	2	8	538324	538331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_011988	T	6	6	538351	538356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011988	TCCAT	2	10	538400	538409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_011988	G	6	6	538412	538417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011988	GCTGG	2	10	538471	538480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_011988	T	6	6	538515	538520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011988	GTC	2	6	540227	540232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011988	CGT	2	6	540261	540266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011988	CTGG	2	8	540275	540282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_011988	CCTT	2	8	540304	540311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_011988	CTT	2	6	540381	540386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011988	TCGTT	2	10	540422	540431	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_011988	TCT	2	6	540437	540442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011988	ATG	2	6	540448	540453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011988	CTTG	2	8	540464	540471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_011988	GA	3	6	540544	540549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011988	ATC	2	6	541741	541746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011988	TTGC	2	8	541747	541754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_011988	A	7	7	541830	541836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011988	TCC	3	9	541916	541924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_011988	GAC	2	6	541958	541963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011988	ATTG	2	8	541964	541971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011988	TG	3	6	545143	545148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011988	GA	4	8	545175	545182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011988	AAT	2	6	546089	546094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011988	CGC	2	6	546095	546100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_011988	ACGT	2	8	546141	546148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_011988	CCG	3	9	546241	546249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011988	CGG	2	6	546258	546263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011988	TC	3	6	547404	547409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_011988	ATG	3	9	547421	547429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011988	GCC	2	6	550845	550850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_011988	GTT	2	6	550905	550910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011988	TTC	3	9	550928	550936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011988	GC	3	6	550957	550962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_011988	GGC	2	6	550985	550990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011988	ACC	2	6	550992	550997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_011988	CCGT	2	8	551109	551116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_011988	T	6	6	552213	552218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011988	TA	3	6	552223	552228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011988	TA	3	6	552237	552242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011988	A	6	6	552269	552274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011988	AAT	2	6	552350	552355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011988	GAAAC	2	10	552463	552472	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_011988	TGA	2	6	555081	555086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011988	TGC	2	6	555135	555140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011988	GGA	2	6	555157	555162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011988	CCAT	2	8	555163	555170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_011988	GAA	2	6	555181	555186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011988	CTG	2	6	562859	562864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011988	TG	3	6	563700	563705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011988	A	6	6	563723	563728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011988	AC	3	6	563777	563782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_011988	GGA	2	6	563797	563802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011988	CTG	2	6	565227	565232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011988	ATCA	2	8	565300	565307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_011988	TTAT	2	8	565390	565397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011988	CGG	2	6	565398	565403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011988	TTTG	2	8	568303	568310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011988	GGT	2	6	577174	577179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011988	GTTG	2	8	577246	577253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011988	TGG	2	6	577290	577295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011988	TGG	2	6	577322	577327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011988	CA	3	6	577336	577341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_011988	CGC	2	6	579233	579238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_011988	AAC	2	6	579261	579266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011988	TGAA	2	8	579316	579323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011988	CAG	2	6	579400	579405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011988	A	6	6	579406	579411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011988	GACTG	2	10	579482	579491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_011988	TCT	2	6	579511	579516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_011988	ATGC	2	8	579608	579615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_011988	GCC	3	9	579624	579632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_011988	GAT	2	6	579915	579920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011988	A	6	6	579997	580002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011988	TC	3	6	582086	582091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_011988	GAC	2	6	582097	582102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_011988	TGA	2	6	582156	582161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011988	T	6	6	584324	584329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011988	GAAT	2	8	584349	584356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011988	CAG	2	6	584357	584362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011988	TATTT	2	10	585143	585152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_011988	TGT	2	6	589290	589295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011988	CTG	2	6	589297	589302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011988	TCC	2	6	590607	590612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_011988	GTG	2	6	590625	590630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011988	CGG	2	6	590657	590662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011988	CCT	2	6	590679	590684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_011988	GTT	2	6	590699	590704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011988	T	7	7	590732	590738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011988	GC	3	6	590762	590767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_011988	CTCC	2	8	590772	590779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1108	NC_011988	CG	3	6	590787	590792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_011988	GCC	2	6	590799	590804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_011988	TGA	2	6	590818	590823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011988	TGCTA	2	10	590855	590864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_011988	TGT	2	6	590878	590883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011988	TTGT	2	8	590894	590901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011988	CGG	2	6	590982	590987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011988	TA	3	6	590999	591004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011988	T	6	6	591022	591027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011988	GGGA	2	8	591059	591066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011988	ACGC	2	8	591080	591087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_011988	GAG	2	6	591113	591118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011988	GAT	2	6	594253	594258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011988	TTGG	2	8	597496	597503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_011988	TGCTA	2	10	597511	597520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_011988	GGC	2	6	597524	597529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011988	ATC	2	6	598231	598236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011988	GTG	2	6	598240	598245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011988	TTG	2	6	598309	598314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011988	TGAAG	2	10	598420	598429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011988	A	6	6	598434	598439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_011988	GAG	2	6	598451	598456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011988	GAG	3	9	598494	598502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_011988	GAG	3	9	598531	598539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011988	GTC	2	6	598543	598548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011988	GA	3	6	598550	598555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011988	GAG	2	6	598569	598574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_011988	ATAA	2	8	598594	598601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_011988	TGCAG	2	10	598636	598645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1138	NC_011988	CGT	2	6	598750	598755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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